未来健康:基因测序的四代发展历程及特点(附20页报告)
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➢ 中国分子诊断市场快速发展,基因测序是最先进的技术。分子检测是利用分子生物学技术,对体液、血液、组织等样本中的核酸物质进行检测和分析。分子检测技术在体外诊断中的应用即为分子诊断,是目前体外诊断领域发展最快、技术最前沿的方向。
➢ 分子检测的分类:根据技术平台的不同可分为聚合酶链核酸扩增技术(PCR)、基因测序、荧光原位杂交(FISH)、基因芯片和核酸质谱等。基因测序技术是最前沿的分子检测技术之一,目前商业化较成熟的为第二代测序技术(NGS),适用于高通量分析,可检测多个突变位点,检测时间较长,成本较高。
➢ 基因测序是一种分子生物学技术,用于确定DNA分子中的核苷酸序列。通过基因测序,科学家可以了解基因的结构、功能以及它们在生物体中的作用。基因测序对于遗传病的诊断、个性化医疗、生物多样性研究以及进化生物学等领域都非常重要。
➢ 基因测序按测序平台分类可以分为第一代、第二代、第三代、第四代测序技术,按测序范围分类可以分为全基因组测序、外显子测序和目标区域测序,按测序目的分类可以分为诊断性测序、研究性测序和个性化医疗测序等。
基因测序技术一般分为四代:1)第一代测序技术(Sanger测序),是上世纪70年代由Sanger和Coulson开创的DNA双脱氧链终止法测序,是最早的测序方法,准确率非常高,但是通量太低,十分耗时,成本高昂;2)第二代测序技术(NGS),又称为高通量测序技术,是为了改进一代测序通量过低的问题而出现的,成本低,准确度高,实现了大规模、高通量测序的目标,是目前应用最广泛的测序技术。3)第三代测序技术(单分子测序),基于单分子实时测序技术,超长读长,实时测序,无需PCR扩增,但准确度相对较低;4)第四代测序(纳米孔测序),通过检测单个核苷酸通过纳米孔时的电流变化来确定DNA序列,具有超长读长,实时测序,便携性高,成本相对较低的特点,但准确度有待提高。
基因测序成本逐年下降,未来大规模商业化应用指日可待。相比PCR技术,基因测序技术可检测未知序列和未知突变的基因,适合高通量、多位点的基因检测,在科研、肿瘤筛查和产前筛查等领域应用较多,但检测费用相对较高。但随着测序技术上限不断被突破,测序成本下降曲线遵循摩尔定律。单人全基因组测序成本已经从2007年的100万美元下降到2020年的不到1000美元,根据华大智造的最新技术,单人全基因组测序的成本已降至100美元以内,这一价格创下了全球新纪录。
目前基因测序已发展到第四代,代表性的为纳米孔技术。它具有超高读长、高通量、更少的测序时间、更便携的仪器(MinION类似U盘大小)和更为简单的数据分析,实现了从低读长到超高读长、从光学检测到电子传导检测的双重跨越。同时,第四代基因测序技术最主要的准确度缺陷正在逐步解决。